霉菌毒素中毒诊断的困难性
1．霉菌毒素中毒的隐蔽性
人们对外表明显发霉的饲料具有警觉性的，但对外观毫无发霉迹象的饲料常常失去了警觉。事实上外观正常饲料的霉菌污染率是高得惊人的。据报道，在80份外观正常的饲料样品中，霉菌毒素超标的有66份，占82.5％，加上虽未超标，但被污染的饲料，被霉菌毒素危害的比例就更大。
外观正常但被污染的饲料原料多由田间霉菌引起的。在籽实成熟前已感染，尤其是在种皮薄弱的胚乳易被霉菌感染，随籽实的长大而被包埋，因此，外观正常。田间霉菌种类繁多，除了黄曲霉菌几个少数仓储性霉菌外，最常致害的赭曲霉、桔青霉、镰孢霉、麦角菌等都是田间霉菌。它们多是形成混合感染隐存于外观正常的饲料籽实中，增加了对动物危害的严重性与损害的多靶性。
2．霉菌毒素中毒的微量性
饲料中黄曲霉毒素含~μg/kg就出现生长受阻、免疫抑制，μg/kg以上有肝脏形态学损伤；赫曲霉毒素μg/kg就有肾脏形态学损伤、增重减慢；单端孢霉毒素3μg/kg时采食减少；F-2毒素1μg/kg以上会出现假发情，直肠脱垂。
霉菌毒素在致病上的微量性多不为人们重视。误认，这么少的霉菌没什么关系，不会引起中毒，从而放松了对其中毒诊断的警惕性。
3．化验室诊断难度较大
主要是因为霉菌毒素种类繁多，分析方法复杂，分析检测费用昂贵，因此，实际生产中一般不靠化验来确诊。
4．霉菌毒素种类多，发病症状复杂
不同霉菌毒素靶器官不同，同一霉菌毒素又可损伤不同的组织和器官，因此，临床症状复杂多变。在黄曲霉毒素中毒时，初期出现食欲减退、贫血、渐进性消瘦，易诊断为慢性消耗性疾病；若出现黄疸，易诊断为附红细胞体病、肝病；当后期出现神经症状时易诊断为李氏杆菌病、脑炎。因此对于临床经验较少，诊断技巧不熟练的人易发生诊断误导。以上案例就是一个明证。
5．霉菌毒素中毒的发病学上的始动作用缺乏直观性，并且这种作用常为发病掩盖
极少量霉菌毒素即可引起猪体发生免疫抑制，这一病损现象在外观上是无法直接观察到的，正是这种免疫抑制可引发多种传染病或细菌感染，后者对前者起到掩盖的作用，易造成误诊。不少猪场的保育猪后期发生呼吸道疾病，但少有人将它与霉菌毒素中毒联系起来（当然还要考虑环境因素），因此防治效果欠佳。
6．霉菌毒素慢性中毒的蓄积性与微量性导致初始症状不明显，病程较长，不易被发现
临床上最多见的就是这种慢性中毒。在群养条件下，部分猪因轻度中毒出现轻微的食欲减退、增重减缓乃至贫血，多不为饲养员与兽医发现，由此造成的漏诊常给猪场带来严重的后果与不应有的损失。
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